Большую часть национального парка занимают лиственные леса. Среди видов деревьев преобладают лесные буки. Они встречаются почти на всех участках лесного сообщества, за исключением незначительных по площади мест. На свежей, богатой питательными веществами почве „Хайниха“, находится экологическое сообщество - буково-злаковый лес. Этот богатый травами буковник  поражает великолепием весенних цветов. Бросаются в глаза подснежник, хохлатка полая, печёночница благородная, фиалка лесная, ветреница дубравная, ветреница лютиковая, черемша и царские кудри.   

В зависимости от расположения  буково - злаковый  лес встречается в различных формах. Нужно назвать обширные заросли черемши, зубянки луковичной и   пролесника многолетнего. По краям откосов и на лёсовых почвах преобладает перловик одноцветный, в то время как на тенисто-прохладном севере и на восточных склонах -  богатые заросли папоротника. На глиняно - лёссовых почвах с поверхностным окислением редко встречаются растения любящие известняк - здесь развиваются буково - подмаренниковые сообщества. 

В экологической системе буково - злакового леса встречаются  бук лесной, клён явор, ясень, граб, шершавый вяз, рябина глоговина и другие виды лиственных деревьев. За исключением жимолости обыкновенной  и волчьеягодника, в тени этого сообщества отсутствуют кустарники. 

На некоторых крутых незащищенных склонах, занимающих лишь незначительную часть,  экологическое сообщество буково - злаковый лес переходит в буково - орхидейное сообщество. В этом  сухом лесу, наряду с ландышами и горной осокой, растут свето - теплолюбивые орхидеи, например булавник червоный и булавник белый, и различные эпидендроидные  (лат.Epipactis и Neottia).  

Рядом с буковниками, при переходе к Тюрингской равнине с более континентальным климатом, находятся богатые липами дубово - грабовые лесные сообщества. Это относительно светлые леса с пышным весенним цветением.

Для травяного покрова типичными являются  звездчатка, подмаренник лесной, бор развесистый и яснотка жёлтая. Среди видов деревьев, наряду с дубом и грабом, преобладают липы, черешня, рябина глоговина и клён полевой.

В общей сложности из флоры этих лиственных лесов на переднем плане стоят широко распространённые виды. Кроме того, здесь существует много редких и исчезающих видов, зависящих от высоковозрастных, богатых структурой лесов.  Это представители грибов, мхов и  лишайников.То же самое типично и для фауны. В зависимости от структуры леса, где мёртвая древесина играет важную роль, здесь проживают широко распространённые виды, а также многочисленные эксклюзивные обитатели. 

В маленьких сырых долинах „Хайниха“ растёт кленово - ясеневый лес. В ещё более сырых местах встречается черная ольха. 

Рядом с этими лесными сообществами, появившимися в „Хайнихе“ естественным путём, встречаются также тополиные лесные участки , а также хвойные сообщества, которые занимают лишь незначительный процент от всей площади леса. 

Различные виды экологических сообществ развиваются на бывших военных полигонах. Известняковые степные сообщества, влажные луга переходят через стадию кустовых сообществ и предлесовых стадий в лесные сообщества. В южной части  „Хайниха“, в связи с проведением танковых учений,  образовались многочисленные мелкие водоёмы со специфической вегетацией. 

Следующие биотопы „Хайниха“ названы в приложении к закону №1 ФФХ (Флора, Фауна,Хабитат), как экологические сообщества европейского значения: буковники, дубравы, грабовые леса, влажно - сырые лесные сообщества, известняково - сухие  степные сообщества.